1. Отсутствуют ярлыки запуска и/или выключения сервера.

Странно, конечно, но и такое, оказывается бывает. В этом случае нужно создать ярлыки для запуска и остановки сервера вручную. Они должны иметь вид:

Запуск сервера: F:\usr\apache\Apache.exe

Остановка сервера: F:\usr\apache\Apache.exe -k shutdown

2. Отсутствует файл F:\usr\apache\conf\httpd.conf

Это случается и имеет отношение, равно как и предыдущий пункт, к различным дистрибутивам Apache. (по этому советую загружать дистрибутив, приведенный здесь!). Итак, файл "httpd.conf" отсутсвует, но есть файл "httpd.conf.default". В этом случае нужно скопировать файл "httpd.conf.default" в "httpd.conf" (именно создать копию этого файла с другим именем, а не переименовывать сам файл. "httpd.conf.default" всегда желательно иметь, так как он является дистрибутивом установок Apache и с его помощью Вы всегда можете вернуться к первоначальным настройкам). Ну а дальше производить все настройки в получившемся файле.

3. Не работает PHP (в броузер выводиться код) или не работает Apache (окошко сразу закрывается).

Проверьте правильность установки и настройки сервера (см. выше). Все пути, настройки, тексты скриптов обязательно должны совпадать с примерами - буква в букву. Иначе проблемы скорее всего будут. Например, Вы поставили слеш в настройках в другую сторону (вместо "/" написали "\" или наоборот) или в тексте скрипта вместо "<?" написали "< ?" (с пробелом) и т.п. Такие ошибки мне вычислять, к сожалению, очень сложно... мне как минимум нужно сесть за Ваш компьютер :)

4. Окно MS-DOS при запуске Apache открывается и сразу же гаснет. Не успеваю даже прочитать, что там написано.

Это означает, что Apache неправильно установлен или настроен. Не стоит сразу же повторять установку (запускать setup) - файлы сервера скопированы верно, ведь ярлык открывает файл Apache.exe. В этом случае обычно неверны настройки сервера. Проверьте файл "httpd.conf" в каталоге "F:\usr\apache\conf\". Особенно внимательно посмотрите на пути (F:\project и т.п.). Не забывайте про слеши! Они должны быть именно такие (в ту сторону), как приведены в примере (см. архив). И, очень важно: там, где их нет (например, в конце путей) не нужно их ставить! В завершение проверьте, что на сервере верна структура каталогов.